La fisiología de las plantas es muy importante para entender el desarrollo de estas en el desierto y cómo finalmente se produce el Desierto Florido.

La germinación de cientos de semillas en estado de latencia de distintas especies, así como el crecimiento de bulbos y el rebrote de especies herbáceas comienza en el transcurso del mes de Julio, gracias a las precipitaciones ocasionadas por causa del Fenómeno del Niño, generando una cubierta vegetal la cual es posible percibir desde fines de Agosto, tanto en el sector costero, como en algunas quebradas, seguido por los sectores de llanos y arenales. La floración y brote no se generan en un mismo período. Se observan ciertas especies tanto en los sectores costeros, como en los sectores llanos. Todo esto depende de los distintos tipos de suelos, humedad y cantidad de agua caída.

Las semillas se encuentran en latencia debido a un factor químico. Despues de la lluvia este químico es removido y la planta sale de su estado de latencia y puede crecer y florecer normalmente.

La floración se inicia a comienzos de Septiembre, no todas las especies florecen simultáneamente como indicamos anteriormente, sino que las primeras especies en florecer son las geófitas o de bulbos, como son las Añañucas amarillas, rojas y rosadas, el Huilli de flores blancas y los Cebollines. También florecen algunas plantas herbáceas y de semilla como los Suspiros , Terciopelos amarillos y rojos, y Heliotropos en laderas de cerros. La primera parte de la floración se da generalmente en manchones y flores aisladas. 


Fuente: Taiz, L. Zeiger, E. Plant Physiology. Sinauer Associates, Inc. (publ.) Sunderland, Massachusetts, 2002.